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一、好菌要多 

 胃和小腸前段因為有胃酸 (強酸) 和膽鹽 (強鹼) 可以幫忙殺菌，所以細菌數量不高。但到了大腸後，PH 值越來越偏向中性，此時細菌就會開始生長，這時食物縻中的細菌數量可高達 數十萬~數百萬/公克 這麼多。
腸內的細菌叢數量是固定的，若是好菌多，相對的壞菌就會少。且好菌 (最常見的代表就是「乳酸菌」) 代謝後可產生有機酸 (例如乳酸) 和抑菌素，可以抑制壞菌的生長。當腸道的好菌多，腸道自然就會健康，較不容易腹瀉、脹氣或便秘，也能預防腸道病變。 
但當壞菌太多時，會產生毒素傷害腸道黏膜，並可能導致腸道細胞病變，增加「大腸癌」的風險。且這些糞便內的毒素會被再吸收到肝臟，間接也增加肝臟的負擔。

二、黏膜要完整 
人體的「皮膚和黏膜」是我們抵抗外來細菌、病毒的第一道防線，當腸道黏膜不完整時 (例如潰瘍、壞菌分泌毒素破壞腸黏膜)，細菌與病毒就有可能進入體內造成感染。且食物當中的未消化完全的大分子，也會經由破損的腸道黏膜進入體內，容易引發食物過敏，這被稱為「腸漏症」 (更多腸漏症說明請看 營養保健方案- 食物過敏)。 
且腸道黏膜也與消化、腸道潤滑、免疫有關，若黏膜太薄則可能會消化不良、腸道敏感容易腹瀉、太乾容易便秘。 
「麩醯胺酸」是腸道細胞主要的營養來源，具有修復黏膜的作用。而要預防黏膜被破壞，當然也要增加腸道好菌才行。飲食上更避免太過於刺激性的食物，像是辣、咖啡因，也會傷害腸黏膜。

三、毒素要清除 
糞便是我們消化吸收後剩餘的廢物，裡面含有很多毒素，因此排便要排得乾淨才不會造成腸道細胞病變 (上述提到的每天最好 2~3 根中型香蕉量)。 最好的腸道排毒營養素就是「膳食纖維」，它就像是腸道裡面的菜瓜布一樣，可以將毒素帶走，並可以包裹住毒素，減少毒素接觸到腸壁的機會。但「膳食纖維」並不是吃越多就越好，若已經有潰瘍的人就不適合吃太多。而且也要留意不宜太過粗糙以免刮傷腸胃，最好的比例是「水溶性膳食纖維」：「非水溶性膳食纖維」＝ 2：1，較不會增加腸胃負擔。若有額外補充「膳食纖維」者，記得一定要多喝水，否則水份不夠時容易會便秘。 

部分資料參考來源 http://donnadiet.com/archives/739